Propagation Chirale Hypercarbonique
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Le mécanisme de propagation chirale ci présenté pour les aminoacides racémiques est une version minimalement dénudé des formes d'équilibre possibles dans le milieu hypercarbonique. Conformément, la N-carboxylation et la protonation du carboxyle de la chaîne principale sont essentielles, mais les vraies espèces réactives peuvent demander l'addition de CO2 ou de l' H2S au matériel peptidique, avec l'usage des aminodiacides ou thioacides correspondants. Hormis le fait que les organismes modernes utilisent des aminoacides optiquement actifs, ce mécanisme est autrement tout à fait congruent avec la biochimie actuelle.
Dans le milieu hypercarbonique les aminoacides sont dépourvus de propriétés zwitterioniques. L'attaque nucléophilique du groupement amino carboxylé au carboxyle protoné procède facilement, donnant origine a un adduit qui contient un carbanion stabilisé par ressonance. La recombinaison asymétrique avec le proton est orientée par l'aminoacide ajouté dans le cycle antérieur. Puisque l'initiation peut être faite par l'acylation avec un acide carboxylique achiral, le premier aminoacide de la chaîne pourra être n'importe quel des deux énantiomères, mais il ira déterminer l'orientation chirale de tous ses subséquents, donant lieu à la synthèse de polypeptides homochiraux. Un autre aspect important c'est que l'acylation du groupement amino du fragment d'aminoacide cause l'élévation du pka du groupement carboxyle, ou la hausse de la probabilité qu'il soit protoné, favorisant ainsi l'allongement des chaînes déjà en cours de formation, plutôt que l'attaque aux monomères. La théorie mécanistique de l'origine de la chiralité dans le monde biologique est un partie integrante du modèle de l'écopoèse pour l'origine de la vie.
Lors de l'édition 13 Février 2008 cette page contient un abrégé autorisé du site officiel de l'Écopoèse [1].
